Javaのアプリケーションではよくあることなんですが、デフォルトだと、フォントが綺麗にならない事があります。NetBeansも突き詰めればJavaのアプリケーションなので、そういった事が起こりえます(Windowsだとどうでしょうか?綺麗なのかな)。Java言語自体がアンチエイリアシングに対応してからもう長いんですが、起動時にオプションが必要な場合があります。